文化：
在神奇宝贝世界，神奇宝贝和人类一起生存，作为训练家的人类会收服神奇宝贝，训练神奇宝贝，和神奇宝贝一起对战，培育神奇宝贝，或者把神奇宝贝作为宠物，亦或作为一门研究的学科，或利用神奇宝贝的能力完成各种工作。许多神奥传说也说人类与神奇宝贝的关系非常亲近，历史上甚至有一段不分彼此的时期。
广义地说，神奇宝贝训练本身就是基于两个这样的问题：训练家和神奇宝贝应该有怎样的关系，如何才能增进这种关系。因为有着不同的观点，不同的训练家也会有不同的训练方式，专长于不同的领域。并没有任何一种方式是正确的训练方式，每一种方式都有其有利于不利的一面。
然而，许多训练方式最终其实都分属两类。第一类是专注于神奇宝贝的感受和幸福，建立强大的友谊；第二类是专注于神奇宝贝的力量和能力。训练家经常会为这两种观点争执不休。在神奇宝贝系列的价值观里，则突出地强调训练家与神奇宝贝之间，友情才是最重要的，而只要有爱与关心，就能发挥出任何神奇宝贝的强大力量。
神奇宝贝世界史显然与现实世界不同，并侧重于描写人类与神奇宝贝相处的部分。在世界上并没有主要的宗教，但许多信仰和神话都围绕着传说中的神奇宝贝，所以也可以说，神奇宝贝是这个世界人类的主要信仰。而且，许多人类都对神奇宝贝表现出友好和尊重，世界各地也有与神话传说相关的神殿。
然而，也有许多人希望利用神奇宝贝满足自己的野心。有些人希望获得物质的收获，而有些人则希望达成一些不被这个世界接受的理想。另外，至少在历史上，神奇宝贝世界曾有过战争，并且分属不同阵营的神奇宝贝也曾参与其中。
神奇宝贝是神奇宝贝世界之中，和人类一起生活的生物。许多人类尊重并善待神奇宝贝，也有一些人类试图滥用神奇宝贝。神奇宝贝具有感情，并在某种程度上能理解人类的语言。生态环境的变化也受神奇宝贝的影响。和现实世界的生物相比，许多神奇宝贝拥有超出现实世界生物的能力。
进化：
在神奥传说中，神奇宝贝和人类最初并不分彼此，属于同一个种群。随着时间的推移，一部分生物演变形成了人类。这种说法在神奇宝贝世界中提到很多次，但并未得到证实。梦幻是所有生物的祖先，它演化成为其它神奇宝贝。最早的人类诞生于数百万年前的石器时代。在生物学和遗传学上，所有的神奇宝贝都同属一种物种的不同分支，所以虽然不同种的神奇宝贝也有可能在饲育屋中生蛋。
在现代的神奇宝贝世界，进化一词专指神奇宝贝在生长到一定阶段、或在特定条件下转变为另一种神奇宝贝的过程。进化并不只是体型变大，一般进化型态的神奇宝贝拥有更强大的种族值，学会不同的技能，甚至改变属性。许多神奇宝贝都可以进化。
神奇宝贝的进化，更类似于现实世界的生物变态而非进化，和进化一词相似的神奇宝贝进化是结草儿，它会根据环境来改变进化后的型态。
繁殖：
几乎所有神奇宝贝都可以进行繁殖。完全进化的，或者经过幼年型态的神奇宝贝可以和相同蛋群的神奇宝贝生蛋。没有性别的神奇宝贝也可以和百变怪生蛋。除了玛纳霏和霏欧纳之外，幼年型态的神奇宝贝以及传说中的神奇宝贝不可以生蛋。和现实世界的生物一样，许多神奇宝贝有性别之分，有些神奇宝贝可以通过性别差异分辨。通常，训练家神奇宝贝一般在神奇宝贝饲育屋中生蛋。神奇宝贝繁殖的方式并不为人所知，也不为人所见。
神奇宝贝在出生之前生活在蛋里，神奇宝贝蛋有坚硬的外壳保护它的成长。蛋的外形通常会有所属的神奇宝贝的花纹。和现实世界的动物一样，神奇宝贝会竭力保护它们的蛋，把蛋守护在离它们很近的地方。在成长到一定程度后，神奇宝贝就会从蛋中孵化出来。神奇宝贝孵化所需要的时间依神奇宝贝的种类而有所不同，但若把蛋存放在电脑里，蛋的成长就会暂停。
有些神奇宝贝有幼年型态。幼年型态的神奇宝贝在进化之后，就可以进行繁殖。许多存在幼年型态的神奇宝贝的蛋只会孵化成为幼年型态；然而有些神奇宝贝的蛋一般会孵化成略成熟一些的型态，只有在生蛋时携带对应的熏香，才会使蛋孵化成幼年型态。
食物：
在神奇宝贝图鉴中，曾多次提到一些神奇宝贝会以其它种类的神奇宝贝为食，比如比雕会从水中捕捉鲤鱼王。一些地方也提到人类会食用神奇宝贝，比如主角妈妈的红莲火山汉堡，火箭队兜售的美味尾巴。大葱鸭也因为被过度捕食而数量锐减。一些神奥传说中也提到了食用神奇宝贝，其中称如果把它们的骨头捡干净放回它们原先所在的地方，神奇宝贝就会获得重生。
分类：
神奇宝贝分布在不同的地区，并由当地的神奇宝贝博士统计，编成神奇宝贝图鉴。大木博士统计了关都地方存在的151种神奇宝贝，和不同地区的神奇宝贝编成全国图鉴，在关都地方、城都地方、丰缘地方、神奥地方、合众地方、卡洛斯地方，一